فرآیند شناسائی مولکولی باکتری Streptococcus facium بعنوان یکی از عوامل ایجاد بیماری استرپتوکوکوزیس در ماهیان قزل آلا

به منظور شناسایی سویه های مختلف عوامل استرپتوکوکوزیس با استفاده از روش تعیین توالی DNA ،تعداد 515 نمونه ماهی قزل آلای آلوده به بیماری استرپتوکوکوزیس از 67 مزرعه پرورش ماهی واقع در 8 استان کشور جمع آوری گردید. ابتدا با روشهای میکروبی، بیوشیمیایی و در نهایت PCR ، گونه Streptococcu faecium شناسایی و تایید گردید. جهت تعیین سویه های مختلف تعداد 18 نمونه (12 نمونه S. faecium انتخاب و تعیین توالی گردید. واکنش PCR با استفاده از پرایمرهای C10 و B37 که براساس توالی ژن 16s rRNA طراحی شده بوده انجام گردید. محصول PCR پس از خالص سازی، تعیین توالی گردید. آنالیز آماری و رسم درخت فایلوژنی به روش UPGM با استفاده از نرم افزارهای Gen Alex و Mega 4 انجام شد. در این بررسی تنوع هاپلوتیپ ها 89/0 و تنوع نوکلئوتیدها 60/0 بود. همچنین میانگین اختلاف نوکلئوتیدها 45/0 بوده است. براساس درخت فیلوژنی رسم شده ، نمونه های گونه S. faecium در یک شاخه قرار گرفت که در این شاخه ، یک نمونه از استان فارس و یک نمونه از استان مازندران در خوشه های جداگانه قرار گرفتند.